雇用保険の計算について、50銭1厘以上も切り捨てとなっております。 また、この1円の差というものはどこかの時点で調整されるものでしょうか？

1円以下の端数処理は「切り捨て」を採用しています。
雇用保険の端数処理は法令で決められた「50銭以下は切り捨て、それ以上は切り上げ」が基本で、労使の慣習等の理由でそのほかの端数処理が認められているようです。
 
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