扶養のない従業員について、配偶者控除「38万円」が勝手に記載されます。

配偶者控除が「有」になっていると思われますので、以下の手順で配偶者控除を「無」にします。
「年末調整」⇒「入力」タブ ⇒「扶養親族等」⇒「配偶者情報編集」画面で、配偶者の有無を「無」を選択し、［保存］ボタンをクリックします。
 
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