給与所得がある場合の複合仕訳入力への借方貸方への勘定科目や入力内容を教えていただきたいです。 また、給与所得に関しては発生主義での申告ではなく「入金主義」で処理をしてよろしいのでしょうか？

弊社よりご回答できる内容は、ソフトの操作方法までとなります。
大変恐縮ではございますが、お近くのお詳しい方（経理ご経験者や税理士事務所など）にお問い合わせください。
 
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