支給項目の詳細設定で「社会保険対象」と「雇用保険対象」のチェックを外したのですが、「標準報酬月額の改定」と「労働保険の年度更新」にて集計したところ、支給項目のすべてが集計されました。

給与項目の「社会保険対象」「雇用保険対象」の設定は、「標準報酬月額の改定」「労働保険の年度更新」の集計に反映されない仕様となっております。
 
「標準報酬月額の改定」「労働保険の年度更新」は集計後に編集が可能になっております。

 
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